Western Blot
experiment
WB的相关知识,我觉得面试可能会问到的
Western Blot(蛋白质免疫印迹)
原理
Western Blot是一种基于抗原-抗体特异性结合的分子生物学技术,用于检测特定蛋白质的存在、相对丰度及分子量。其核心原理包括以下三部分:
SDS-PAGE电泳分离
- SDS(十二烷基硫酸钠):破坏蛋白质的非共价键,使蛋白质变性为线性结构,并均匀包裹负电荷(电荷与质量比相同)。
- PAGE(聚丙烯酰胺凝胶电泳):利用凝胶的孔径筛作用,根据蛋白质分子量大小进行分离(小分子迁移快,大分子迁移慢)。
蛋白质转移至固相膜
- 通过电转移(湿转或半干转)将凝胶中的蛋白质转移到PVDF膜或NC膜上,固定蛋白质以供后续检测。
抗体识别与显色/发光
- 一抗:特异性识别目标蛋白。
- 二抗:标记有HRP(辣根过氧化物酶)或荧光素,与一抗结合后通过化学发光、显色或荧光成像显示目标蛋白位置。
二、实验步骤
1. 样本制备
- 细胞/组织裂解
- 裂解液选择:
- 普通细胞:RIPA裂解液(含1% PMSF)。
- 难溶蛋白:加入1% SDS或NP-40。
- 磷酸化蛋白:需添加磷酸酶抑制剂(如Na₃VO₄、NaF)。
- 裂解条件:
- 动物组织:30分钟内处理,切块冻存(-80℃)。
- 植物样本:液氮研磨,保留健康组织。
- 裂解后离心(4℃,12000-15000 rpm,10-15 min)取上清。
- 裂解液选择:
- 蛋白定量
- BCA法:标准品复孔,样品稀释5-10倍,37℃孵育30 min,562 nm读数(R²>0.99)。
- Bradford法:适用于可溶蛋白,但可能受不可溶蛋白干扰。
- 变性处理
- 加入5×loading buffer(比例1:4),100℃煮沸10-20 min,使蛋白完全变性。
2. SDS-PAGE电泳
- 凝胶制备
- 分离胶浓度选择:
- 小分子量蛋白(<30 kDa):12-15%胶。
- 中等分子量(30-70 kDa):8-12%胶。
- 大分子量(>70 kDa):6-8%胶。
- 灌胶步骤:
- 分离胶灌注后加水封胶,凝固后吸去水层。
- 浓缩胶(5%)灌注并插入梳子,凝固后拔除梳子形成上样孔。
- 分离胶浓度选择:
- 电泳条件
- 浓缩胶:80 V,30-40 min(使样品压缩成线)。
- 分离胶:120 V,1-1.5 h(根据蛋白大小调整时间)。
- 注意事项:电泳缓冲液需预冷,避免高温导致“微笑条带”。
3. 蛋白质转膜
- 膜选择
- PVDF膜:机械强度高,适合多次剥脱,需甲醇活化。
- NC膜:信噪比高,无需甲醇预处理,但不适合含SDS的转膜缓冲液。
- 转膜步骤
- 转膜缓冲液:含甲醇(20%),预冷至4℃。
- 转膜装置:组装“三明治”(
-
海绵→滤纸→凝胶→膜→滤纸→海绵+
),确保无气泡。 - 转膜参数:
- 30 kDa以下:30 min,220 mA。
- 30-70 kDa:60-90 min,220 mA。
- 70-150 kDa:90-180 min,220 mA。
- 验证转膜:丽春红染色或考马斯亮蓝染色观察蛋白转移效果。
4. 封闭与抗体孵育
- 封闭
- 5%脱脂牛奶/TBST:室温1 h,阻断非特异性结合位点。
- 快速封闭液:可缩短封闭时间(如10 min)。
- 一抗孵育
- 稀释比例:根据抗体说明书(如1:1000)。
- 孵育条件:室温1 h或4℃过夜(需覆盖膜防止干燥)。
- 二抗孵育
- HRP标记二抗:稀释比例1:5000,室温1 h避光孵育。
- 荧光标记二抗:适用于多色检测,需配合成像系统。
- 洗涤
- TBST/PBST:室温摇洗3次,每次10 min,去除未结合抗体。
5. 显色与成像
- 化学发光法(ECL)
- 显色时间:常规底物1 min,高性能底物(如SuperSignal)5 min。
- 成像:使用X光胶片或化学发光成像仪(推荐后者,灵敏度更高)。
- 显色法(DAB)
- 适用于低丰度蛋白,但可能产生背景干扰。
- 荧光法
- 多色检测时需使用兼容的荧光成像系统。
三、关键注意事项
- 样本处理
- 新鲜样本优先:动物组织30分钟内处理,植物样本去除枯黄部分。
- 冻存规范:分装≤1 g,加入RNAlater防降解,标记清晰。
- 裂解液与抑制剂
- 现用现加抑制剂:蛋白酶/磷酸酶抑制剂需在使用前加入裂解液。
- 裂解时间控制:细胞裂解30 min,组织匀浆2 h(4℃)。
- 电泳与转膜优化
- 凝胶选择:根据蛋白分子量选择梯度胶或均一胶。
- 转膜效率:避免高电压导致膜破损,必要时使用预染Marker监控转膜。
- 抗体使用
- 稀释比例:根据抗体说明书调整,避免过高浓度过高背景。
- 对照设置:阳性/阴性对照(如内参蛋白GAPDH、β-Actin)确保特异性。
- 背景控制
- 封闭充分:避免非特异性结合。
- 内源IgG干扰:使用TidyBlot试剂(仅结合完整IgG)减少背景。
- 定量与重复
- BCA/Braford:确保上样量一致(20-40 μg总蛋白)。
- 重复实验:至少3次独立实验验证结果可靠性。
- 设备与耗材
- 低温操作:离心机、电泳槽提前预冷,防止蛋白降解。
- 膜保存:未使用的膜密封于-20℃,避免潮解。
四、常见问题与解决方案
问题 | 可能原因 | 解决方案 |
---|---|---|
条带模糊或无信号 | 蛋白变性不完全、转膜失败 | 延长煮样时间,优化转膜参数 |
高背景信号 | 封闭不充分、抗体浓度过高 | 增加封闭时间,降低抗体稀释比例 |
条带位置异常 | 蛋白修饰(如磷酸化)、凝胶孔径不适 | 使用非还原条件,调整凝胶浓度 |
转膜不均 | 凝胶与膜之间有气泡 | 重新组装转膜装置,排除气泡 |
内参蛋白信号弱 | 上样量不足、内参抗体失效 | 增加上样量,验证内参抗体有效性 |
五、总结
Western Blot是蛋白分析的“金标准”,其成功依赖于严谨的样本处理、精确的电泳与转膜条件以及特异性抗体的合理使用。通过优化每一步骤(如裂解液配制、定量方法、抗体稀释),可显著提高实验重复性和数据可靠性。对于复杂样本(如组织裂解物),需特别注意内源干扰和背景控制。掌握这些细节,才能高效完成高质量的Western Blot实验。
Western Blot样本制备的原理与方法步骤
一、原理
Western Blot样本制备的核心目标是高效释放细胞或组织中的蛋白质,同时保持其完整性和活性,以便后续的电泳分离和检测。具体原理包括:
- 裂解细胞/组织
- 通过裂解液破坏细胞膜和细胞器,释放蛋白质。裂解液通常含去垢剂(如SDS、Triton X-100)和盐类,以溶解膜结构。
- 抑制蛋白降解
- 添加蛋白酶抑制剂(如PMSF、EDTA)和磷酸酶抑制剂(如Na₃VO₄),防止蛋白酶或磷酸酶在裂解过程中降解目标蛋白或修饰其活性。
- 定量与变性处理
- 通过蛋白定量(如BCA法)确定样品浓度,确保上样量一致;加入SDS-PAGE上样缓冲液使蛋白质变性,便于电泳分离。
二、方法步骤
1. 细胞裂解
(1)悬浮细胞
- 步骤:
- 离心收集细胞(1000-1500 rpm,5 min)。
- 用PBS洗涤1-2次,去除培养液中的血清和杂质。
- 加入裂解液(如RIPA裂解液,含蛋白酶/磷酸酶抑制剂),冰上裂解30 min。
- 若裂解不充分,可冰浴超声辅助裂解。
- 离心(4℃,12000-15000 rpm,10-15 min),取上清液用于后续实验。
(2)贴壁细胞
- 步骤:
- 吸净培养液,用PBS洗涤1-2次。
- 加入裂解液直接裂解(或胰酶消化后按悬浮细胞处理,但需注意胰酶可能降解某些蛋白)。
- 冰上裂解30 min,离心后取上清。
(3)裂解液选择
- 常规裂解液:RIPA(含1% Triton X-100、0.1% SDS)。
- 难溶蛋白:添加1% SDS或NP-40。
- 磷酸化蛋白:需额外添加磷酸酶抑制剂(如Na₃VO₄、NaF)。
2. 组织裂解
(1)预处理
- 去除非目标成分:洗净血液、脂肪等(尤其对脾脏、心脏等富含IgG的组织)。
- 灌流处理:实验动物可通过心脏灌注生理盐水(含PMSF),使组织颜色变白后再采集。
(2)破碎方法
- 匀浆法:
- 按比例加入裂解液(如1:5组织重量:裂解液体积)。
- 使用玻璃匀浆器或电动匀浆器匀浆至无明显组织块。
- 研磨法:
- 液氮冷冻组织后,在研钵中研磨成粉末。
- 加入裂解液裂解,混合均匀。
(3)离心与上清收集
- 4℃离心(12000-15000 rpm,10-15 min),取上清液。
3. 蛋白定量
(1)BCA法
- 原理:蛋白质在碱性条件下将Cu²⁺还原为Cu⁺,与BCA试剂反应生成紫色复合物,562 nm比色。
- 步骤:
- 制作标准曲线(BSA梯度稀释)。
- 样品稀释5-10倍,与BCA工作液混合,37℃孵育30 min。
- 测定吸光度(R²>0.99时可靠)。
(2)Bradford法
- 原理:考马斯亮蓝G-250染料与蛋白质结合后发生颜色变化(465-595 nm)。
- 优点:快速、灵敏,适合可溶蛋白;但易受不可溶蛋白干扰。
4. 变性处理
目的:使蛋白质完全变性,消除空间结构对电泳的影响。
步骤:
- 加入5×SDS-PAGE上样缓冲液(1:4体积比)。
- 100℃煮沸10-20 min,或55℃加热30 min(避免高温降解敏感蛋白)。
- 冰浴冷却后进行电泳。
三、关键注意事项
- 防止蛋白降解
- 全程低温操作(冰上裂解、4℃离心)。
- 裂解液中必须现加蛋白酶/磷酸酶抑制剂。
- 分装与保存
- 裂解液和样品避免反复冻融,分装后-80℃保存。
- 组织处理技巧
- 富含IgG的组织(如脾脏)需充分洗涤,避免内源抗体干扰。
- 液氮研磨适用于难裂解组织,但需注意研磨均匀性。
- 裂解效率优化
- 难裂解细胞可尝试超声破碎或增加裂解液浓度。
- 胰酶消化可能导致蛋白片段化,需根据实验需求权衡。
四、常见问题与解决方案
问题 | 可能原因 | 解决方案 |
---|---|---|
蛋白浓度偏低 | 裂解不充分、组织未破碎完全 | 增加裂解时间,改用液氮研磨 |
高背景信号 | 内源IgG干扰(如脾脏组织) | 充分洗涤组织,使用低IgG裂解液 |
蛋白降解 | 蛋白酶抑制剂失效或操作过热 | 现加抑制剂,全程低温操作 |
上样量不一致 | 定量误差 | 重复BCA/Bradford测定,取平均值 |